Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRE11P49959 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRE11P49959 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRE11P49959 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms