Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSR1P43307 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR1P43307 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSR1P43307 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms