Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EIF4A3P38919 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4A3P38919 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms