Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LTBRP36941 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LTBRP36941 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LTBRP36941 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms