Protein–RNA interactions for Protein: P32074

SEC21, Coatomer subunit gamma, yeast

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC21	P32074	TOP2	YNL088W	4287 nt		2.71	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YPR089W	YPR089W	2667 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YOR302W	YOR302W	78 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	VMA9	YCL005W-A	222 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	NUP120	YKL057C	3114 nt		2.7	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YDR426C	YDR426C	378 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YNL028W	YNL028W	318 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	FPR1	YNL135C	345 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	CRS5	YOR031W	210 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.69	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	HYP2	YEL034W	474 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YOR170W	YOR170W	306 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	SNC2	YOR327C	348 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	RRP12	YPL012W	3687 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	VPS35	YJL154C	2835 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	TMN3	YER113C	2121 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.68	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YRB1	YDR002W	606 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	NUT2	YPR168W	474 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	UBP1	YDL122W	2430 nt		2.67	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	PEX8	YGR077C	1770 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	SMY2	YBR172C	2223 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YEL014C	YEL014C	306 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YLR342W-A	YLR342W-A	174 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	RPS29A	YLR388W	171 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	CSE2	YNR010W	450 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YBR224W	YBR224W	516 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	PRP6	YBR055C	2700 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	FAR11	YNL127W	2862 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	AMS1	YGL156W	3252 nt		2.66	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	YKU80	YMR106C	1890 nt		2.65	□□□□□ -1.98
SEC21	P32074	tF(GAA)Q	tF(GAA)Q	75 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	UPS1	YLR193C	528 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YMR194C-A	YMR194C-A	225 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	VIK1	YPL253C	1944 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.65	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	LCD1	YDR499W	2244 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	TRS65	YGR166W	1683 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	VPH1	YOR270C	2523 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	VPS55	YJR044C	423 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	TRX1	YLR043C	312 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YOR333C	YOR333C	417 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SWA2	YDR320C	2007 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	EFR3	YMR212C	2349 nt		2.64	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	HRD3	YLR207W	2502 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SMC6	YLR383W	3345 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	FMP16	YDR070C	282 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YLR255C	YLR255C	354 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YMR321C	YMR321C	318 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YPR002C-A	YPR002C-A	198 nt		2.63	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	ORC2	YBR060C	1863 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YER088C-A	YER088C-A	324 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YJL150W	YJL150W	303 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YLR120W-A	YLR120W-A	102 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	ACM1	YPL267W	630 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	COS111	YBR203W	2775 nt		2.62	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	CFT2	YLR115W	2580 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	OLI1	Q0130	231 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SMD1	YGR074W	441 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	KRE33	YNL132W	3171 nt		2.61	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SNF5	YBR289W	2718 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	NOP10	YHR072W-A	177 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YBR184W	YBR184W	1572 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SEF1	YBL066C	3447 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SMY1	YKL079W	1971 nt		2.6	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	MDM20	YOL076W	2391 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YNL170W	YNL170W	396 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	YOR015W	YOR015W	360 nt		2.59	□□□□□ -1.99
SEC21	P32074	SGM1	YJR134C	2124 nt		2.59	□□□□□ -2
SEC21	P32074	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	VPS34	YLR240W	2628 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	PRP39	YML046W	1890 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	SSS1	YDR086C	243 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	YGR050C	YGR050C	357 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	YLR149C	YLR149C	2193 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	CDC27	YBL084C	2277 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	YNL018C	YNL018C	1839 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	NOP53	YPL146C	1368 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.58	□□□□□ -2
SEC21	P32074	KAP123	YER110C	3342 nt		2.58	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.9 ms