Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PLNP26678 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PLNP26678 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PLNP26678 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
PLNP26678 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms