Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP100P23497 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SP100P23497 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SP100P23497 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SP100P23497 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SP100P23497 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SP100P23497 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SP100P23497 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms