Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GCSHP23434 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GCSHP23434 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GCSHP23434 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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