Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EPHA1P21709 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms