Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB1P20618 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms