Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM3P06753 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM3P06753 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM3P06753 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM3P06753 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM3P06753 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM3P06753 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM3P06753 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPM3P06753 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPM3P06753 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms