Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSD2O96028 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSD2O96028 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSD2O96028 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSD2O96028 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NSD2O96028 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
NSD2O96028 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSD2O96028 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSD2O96028 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms