Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MBD3O95983 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MBD3O95983 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MBD3O95983 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MBD3O95983 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms