Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALMO75781 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALMO75781 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALMO75781 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALMO75781 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALMO75781 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PALMO75781 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PALMO75781 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PALMO75781 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms