Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TIMM17BO60830 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms