Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DENRO43583 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DENRO43583 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DENRO43583 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DENRO43583 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DENRO43583 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DENRO43583 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DENRO43583 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms