Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CSK-203ENST00000562066 533 ntTSL 412.71□□□□□ -0.374e-11■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 212.29□□□□□ -0.444e-11■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 CCDC137-203ENST00000572531 265 ntTSL 310.76□□□□□ -0.693e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 46.62□□□□□ -1.354e-11■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.158e-8■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 217.21■□□□□ 0.358e-8■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 PLCXD1-207ENST00000443019 284 ntTSL 513.36□□□□□ -0.276e-11■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 319.18■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 TSPAN4-212ENST00000494815 2187 ntTSL 218.88■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 SSTR5-AS1-205ENST00000624643 1010 nt18.66■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 TSPAN4-211ENST00000468468 2777 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 TSPAN4-218ENST00000529566 706 ntTSL 215.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 LZTR1-212ENST00000480895 539 ntTSL 413.49□□□□□ -0.253e-8■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 BRD9-203ENST00000475706 744 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 PABPC1L-213ENST00000481196 488 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.263e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 20.5
PRPF4O43172 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.16□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 20.5
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PRPF4O43172 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PPP4C-212ENST00000567828 742 ntTSL 321.59■■□□□ 1.059e-7■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 516.38■□□□□ 0.212e-8■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 20.4
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PRPF4O43172 PLXND1-204ENST00000504524 1701 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.563e-9■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.443e-9■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PLXND1-214ENST00000512744 2662 ntTSL 1 (best)17.47■□□□□ 0.393e-9■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 317.95■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 58.13□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 NOL3-210ENST00000568086 578 ntTSL 414.98□□□□□ -0.014e-6■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-207ENST00000613043 574 ntTSL 512.12□□□□□ -0.472e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-204ENST00000493935 763 ntTSL 411.72□□□□□ -0.532e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-208ENST00000615790 6394 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PEG10-202ENST00000482108 6618 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 423.69■■□□□ 1.389e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.519e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.169e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 515.62■□□□□ 0.099e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 312.63□□□□□ -0.399e-8■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 BRAT1-206ENST00000493232 5360 ntTSL 217.14■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 BRAT1-204ENST00000469750 5226 ntTSL 216.49■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 20.4
PRPF4O43172 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 20.4
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