Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNPO2O14787 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNPO2O14787 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms