Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NPIPA5E9PKD4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NPIPA5E9PKD4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms