Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HIGD1CA8MV81 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIGD1CA8MV81 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms