Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEMP2A6NFY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms