Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms