Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNX8Q9Y5X2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX8Q9Y5X2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms