Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms