Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SETD1BQ9UPS6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SETD1BQ9UPS6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms