Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1RE1Q9UN81 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms