Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFNKQ9P0W0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFNKQ9P0W0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms