Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PODXL2Q9NZ53 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PODXL2Q9NZ53 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms