Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms