Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHCHD3Q9NX63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHCHD3Q9NX63 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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