Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3EQ9NVU0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR3EQ9NVU0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms