Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SALL1Q9NSC2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SALL1Q9NSC2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms