Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLXNA4Q9HCM2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA4Q9HCM2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms