Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCOLN1Q9GZU1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms