Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTR3CQ9C0K3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms