Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM5Q9C035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms