Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PHF12Q96QT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PHF12Q96QT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms