Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARXQ96QS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms