Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB3A2Q96PL1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB3A2Q96PL1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms