Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
YTHDC1Q96MU7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
YTHDC1Q96MU7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms