Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC97Q96F63 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms