Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms