Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms