Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC102AQ96A19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC102AQ96A19 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms