Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKD2Q969F2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms