Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRUQ92729 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms