Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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