Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms