Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKAP2LQ8IYA6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKAP2LQ8IYA6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms