Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HAPLN4Q86UW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HAPLN4Q86UW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms